Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Plod1Q9R0E2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Plod1Q9R0E2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms