Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fhl3Q9R059 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.9 ms