Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AmfrQ9R049 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms