Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms