Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb11Q9QY30 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcb11Q9QY30 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcb11Q9QY30 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms