Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt17Q9QWL7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt17Q9QWL7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt17Q9QWL7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms