Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms