Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm2bQ9JME9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm2bQ9JME9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms