Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CubnQ9JLB4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CubnQ9JLB4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms