Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms