Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdk2Q9JK42 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdk2Q9JK42 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pdk2Q9JK42 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms