Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc86Q9JJ89 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms