Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FliiQ9JJ28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FliiQ9JJ28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FliiQ9JJ28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms