Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim54Q9ERP3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim54Q9ERP3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim54Q9ERP3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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