Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3bpQ9EQG9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms