Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a1Q9EPE9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a1Q9EPE9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms