Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf580Q9DB38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf580Q9DB38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms