Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc89Q9DA73 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc89Q9DA73 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms