Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9D9S1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9D9S1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D9S1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms