Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms