Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D7E4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D7E4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms