Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc81Q9D5W4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc81Q9D5W4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc81Q9D5W4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms