Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubxn11Q9D572 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn11Q9D572 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms