Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930578G10RikQ9D4Q4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930578G10RikQ9D4Q4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms