Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4931423N10RikQ9D4J9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms