Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmntd1Q9D4C1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms