Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ss18l2Q9D174 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ss18l2Q9D174 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ss18l2Q9D174 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ss18l2Q9D174 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ss18l2Q9D174 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ss18l2Q9D174 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ss18l2Q9D174 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ss18l2Q9D174 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ss18l2Q9D174 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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