Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms