Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrs1Q9CYH6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrs1Q9CYH6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrs1Q9CYH6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrs1Q9CYH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrs1Q9CYH6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrs1Q9CYH6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrs1Q9CYH6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrs1Q9CYH6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms