Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tdrd12Q9CWU0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms