Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp13a2Q9CTG6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp13a2Q9CTG6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp13a2Q9CTG6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp13a2Q9CTG6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp13a2Q9CTG6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp13a2Q9CTG6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp13a2Q9CTG6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms