Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snw1Q9CSN1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms