Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms