Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQC3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CQC3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQC3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CQC3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CQC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CQC3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms