Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms