Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bap1Q99PU7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms