Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt23Q99PS0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt23Q99PS0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms