Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap4Q99P47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap4Q99P47 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap4Q99P47 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cntnap4Q99P47 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cntnap4Q99P47 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cntnap4Q99P47 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms