Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrapQ99MP8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms