Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprtQ99M80 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprtQ99M80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms