Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmp1Q99KU0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms