Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Reep3Q99KK1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Reep3Q99KK1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms