Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa5aQ99KC8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa5aQ99KC8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vwa5aQ99KC8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa5aQ99KC8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa5aQ99KC8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms