Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Nrbp1Q99J45 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrbp1Q99J45 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrbp1Q99J45 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms