Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim59Q922Y2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms