Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarca5Q91ZW3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarca5Q91ZW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarca5Q91ZW3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms