Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps36Q91XD6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms