Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vstm2aQ8R0A6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms