Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Abcf3Q8K268 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms