Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q4Q8HWB2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q4Q8HWB2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms